पोस्ट ग्रेजुएट विभाग के रूप में बॉटनी विभाग की शुरुआत वर्ष 1973 में एचएनबी गढ़वाल विश्वविद्यालय की स्थापना के साथ हुई। इससे पहले यह बिड़ला सरकार में एक विभाग था। 1962 से डिग्री कॉलेज केवल यूजी स्तर के शिक्षण के साथ। तब से, विभाग ने शिक्षण और अनुसंधान दोनों में उल्लेखनीय प्रगति की है। 2004 में विभाग ने माइक्रोबायोलॉजी में पीजी कोर्स शुरू किया। वर्तमान में विभाग वनस्पति विज्ञान और माइक्रोबायोलॉजी दोनों में स्नातक और स्नातकोत्तर शिक्षण प्रदान करने के लिए अच्छी तरह से सुसज्जित है।

विभाग को विशेष रूप से हिमालयी वनस्पति संपदा के क्षेत्र में पारिस्थितिकी और संरक्षण, वर्गीकरण, पाल्योलॉजी, माइकोलॉजी और पादप विज्ञान के अन्य क्षेत्रों में पाठशालाओं से लेकर उच्च हिमालय तक के क्षेत्र में उत्कृष्ट अनुसंधान गतिविधियों के लिए जाना जाता है। हाल ही में विभाग ने माइक्रोबायोलॉजी- मिट्टी, पर्यावरण और नैदानिक ​​सूक्ष्म जीव विज्ञान के विभिन्न पहलुओं में अनुसंधान शुरू किया है। इनके अलावा, विभाग विभिन्न उभरते क्षेत्रों में पीजी स्तर पर विशेषज्ञता पाठ्यक्रमों के माध्यम से गुणवत्तापूर्ण शिक्षा भी प्रदान कर रहा है। जैव विविधता और संरक्षण, वन पारिस्थितिकी, रिमोट सेंसिंग तकनीक और अनुप्रयोग, मेलिस्सोपालिनोलॉजी, प्लांट हेल्थ मैनेजमेंट, माइक्रोबायोलॉजी और पर्यावरण माइक्रोबायोलॉजी में वर्तमान रुझान।