इसके विशाल दायरे को स्वीकार करते हुए, फार्मास्युटिकल साइंसेज विभाग की स्थापना फार्मेसी में डिग्री कोर्स की शुरुआत के साथ 1996 में सेल्फ फाइनेंस मोड पर की गई थी। वर्तमान में चौरस परिसर में स्थित, विभाग के पास पहला संस्थान होने का सम्मान है, जिसे उत्तराखंड में फार्मेसी काउंसिल ऑफ इंडिया (पीसीआई) द्वारा अनुमोदित किया गया है, इसके अलावा एआईसीटीई द्वारा भी अनुमोदित किया गया है। विभाग के अच्छी संख्या में छात्रों ने उच्च प्रतिशत प्राप्त करने के लिए गेट परीक्षा उत्तीर्ण की है। छात्रों को फार्मेसी और अन्य संबद्ध विषयों में मास्टर डिग्री और पीएचडी का पीछा करने के लिए चुना गया है। राष्ट्रीय और अंतर्राष्ट्रीय ख्याति के संस्थानों में जैव प्रौद्योगिकी, जैव सूचना विज्ञान, प्रबंधन आदि। विभाग के पूर्व छात्रों को अच्छी तरह से दवा और संबद्ध उद्योगों जैसे खाद्य और औषधि प्रशासन, अकादमिया, अनुसंधान संगठनों, नियामक मामलों, सामुदायिक फार्मेसी आदि में रखा जाता है।
संकाय सदस्यों और छात्रों के पीएचडी और स्नातकोत्तर अनुसंधान कार्य के अलावा, वर्तमान में यूजीसी और एआईसीटीई और यूकोस्ट द्वारा वित्त पोषित चार व्यक्तिगत अनुसंधान परियोजनाएं विभाग में चल रही हैं। एक प्रमुख व्यक्तिगत डीएसटी परियोजना (रसायन विज्ञान विभाग के सहयोग से) और एक अंतर्राष्ट्रीय व्यक्तिगत परियोजना (फार्मेसी, मीजो विश्वविद्यालय, नागोया, जापान के संकाय के सहयोग से) वर्ष 2011-12 में पूरी हो चुकी है।
इसके अलावा एम.फार्मा (औषध-निर्माण विज्ञान), एक और स्नातकोत्तर पाठ्यक्रम- एम.एससी. (फार्मास्युटिकल केमिस्ट्री) भी उत्तराखंड में और उसके आसपास के अंतःविषय अनुसंधान की आवश्यकता और फार्मास्युटिकल उद्योगों की मांग को पूरा करने के लिए चलाया जा रहा है। संकाय सदस्य विभिन्न राष्ट्रीय और अंतर्राष्ट्रीय सम्मेलनों में अपने शोध कार्य प्रस्तुत करते रहे हैं और उन्होंने अपने शोध पत्र राष्ट्रीय और अंतर्राष्ट्रीय पत्रिकाओं में प्रकाशित किए हैं।
वर्ष 2011-12 के दौरान संकाय सदस्यों और छात्रों ने विभिन्न राष्ट्रीय और अंतर्राष्ट्रीय पत्रिकाओं में 28 पत्र प्रकाशित किए हैं और विभिन्न सेमिनार / कार्यशालाओं / सम्मेलनों में 08 पत्रों को प्रस्तुत किया है। विभाग ने 02 अनुसंधान परियोजनाओं को भी पूरा कर लिया है और अन्य 03 में कार्य प्रगति पर है। इसके अलावा, संकाय सदस्यों ने भारत में दो पेटेंट दायर किए हैं।